乙型肝炎病毒B2和C2亚型中SSRs的比较分析

• 作者: 冯海平 李丹 李明福 欧阳清检 谭钟扬 赵相艳
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 简单重复序列 乙型肝炎病毒 亚型
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 275-280
• 分类号: Q518.2
• 字数: 3974字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.04.03

摘要

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)属于嗜肝DNA病毒科(hepadnaviridae),它分布在世界各地并严重危害人类的健康.本文从NCBI的GenBank中下载了106条B2亚型和130条C2亚型的基因组全长序列,以下载的数据为材料,分析简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)在B2和C2亚型基因组序列中的分布情况.结果显示,简单重复序列的重复次数比较少；二型简单重复序列在研究的五种简单重复序列类型中占绝对优势；这可能与B2和C2亚型基因组序列有较高的突变率有关.同时还发现最普遍的SSRs、序列间SSRs的平均相对丰度和平均相对密度在B2和C2亚型中分布情况相似.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李丹		58	356	9.0	18.0
2	李明福		68	508	13.0	19.0
3	谭钟扬		12	21	3.0	4.0
4	赵相艳		4	12	2.0	3.0
5	冯海平		2	6	2.0	2.0
6	欧阳清检		2	6	2.0	2.0