利用SSR、EST-SSR、SNP标记对鲤食物转化率、体厚、体质量3种性状的分析

• 作者: 孙效文 张天奇 张晓峰 李文升 王宣朋
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鲤 EST-SSR SNP 食物转化率 体厚 体质量
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 565-573
• 分类号: S917
• 字数: 5112字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2011.00565

摘要

利用Windows Map Manager2.0的标记回归法对鲤(Cyprinus carpio L.)F2群体进行单标记定位分析.用91个SSR标记、33个EST标记、364个SNP标记对鲤进行全基因组扫描,结果得到与食物转化率、体厚、体质量3个性状显著相关(P＜0.05)的标记,分别为27、35、27个,其中与食物转化率相关的标记SNP0041、SNP0044,其相关性达到极显著水平(P＜0.001),贡献率分别达到15%、16%.这些标记可作为分子标记辅助育种的参考标记.将得到的与食物转化率显著相关的EST座位HLJEl4、HLJE253和与体质量显著相关的HLJE253座位在NCBI上进行BLAST比对,结果显示HLJE253与斑马鱼上编码ORF2结构蛋白的基因相关,相关程度达61%.将得到的与3种性状相关的SNP标记在NCBI上进行序列查找,通过Blast比对找到相关的基因,并对可能的功能作了注释.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙效文	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	159	3935	35.0	57.0
2	王宣朋	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	3	80	3.0	3.0
6	张晓峰	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	18	204	7.0	14.0
7	李文升	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	4	84	4.0	4.0
11	张天奇	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	4	86	4.0	4.0