亚麻EST-SSR标记开发

• 作者: 姜硕 李明 苏钰 郑东泽
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 亚麻 EST-SSR 分子标记
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 74-79
• 分类号: S435.63|Q949.9
• 字数: 3177字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9369.2012.04.013

摘要

为了进一步开发利用现有亚麻EST-SSR资源,从NCBI公共数据库下载7947条亚麻EST,去除低质量和冗余序列后,筛选得到含有SSR的序列共239条,检出率为3.0％.其中二核苷酸重复49条,共7个重复类型；三核苷酸重复160条,共41个重复类型；四核苷酸重复30条,共11个重复类型.根据不同的重复类型共设计65对EST-SSR引物,在20份材料PCR扩增检测结果表明,有52对引物有目的扩增产物,其中32对扩增条带清晰且具有多态性,占设计引物的49.2％,通过聚类分析可将20份亚麻材料划分为五大类,验证了EST-SSR分子标记在亚麻遗传多样性分析中应用的可行性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李明	东北农业大学农学院	87	1222	18.0	32.0
2	苏钰	东北农业大学农学院	3	24	2.0	3.0
3	姜硕	东北农业大学农学院	3	33	3.0	3.0
4	郑东泽	东北农业大学农学院	2	15	2.0	2.0