Dehouck-Gilis-Rooman统计势能函数的简化

• 作者: 杜丽琴 陆文伟 韦宇拓 黄日波
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 诱导蛋白数据集 能量函数性能 蛋白质结构预测 统计有效能函数 富集
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 22-28
• 页数: 7页
• 分类号: Q518.2
• 字数: 5633字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.01.04

摘要

统计有效能函数(Statistical effective energy function (SEEF))又称统计势能函数,来源于对已知蛋白质结构数据库进行的统计分析.近年来Dehouck-Gilis-Rooman (DGR)小组通过将蛋白质结构的总体统计势能分解成低阶的势能项之和,提出了一种新型的统计势能函数,这种势能函数由有限个可加和的项组成.我们试图对这种势能函数进行简化,即通过诱导蛋白质数据库选择尽可能少的势能项,而且这些势能项的加和可满足一定的性能要求.结果我们得出了六组势能项组合,其性能可和DGR小组得出的势能项组合相媲美,但其势能项数目却大大减少,完全可用于蛋白质结构预测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜丽琴	广西大学生命科学与技术学院	33	117	7.0	9.0
2	韦宇拓	广西大学生命科学与技术学院	83	584	14.0	20.0
3	黄日波		84	623	14.0	19.0
7	陆文伟	广西大学数学与信息科学学院	6	28	3.0	5.0