基于Bioperl实现远程自动获取抗逆基因序列

• 作者: 张晓婧 曹兴芹 潘伟民
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: BioPerl E-Utilities 远程自动获取 抗逆基因
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 185-188
• 页数: 4页
• 分类号: Q343.1
• 字数: 3509字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2014.03.06

摘要

BioPerl对于现今大量的生物数据来说，具有很好的获取和处理能力，并且NCBI提供了可以直接访问它下属的 Entrez数据库（包括 PubMed）的编程接口，即E-Utilities。为了从NCBI中自动获取大量抗逆基因序列，使得生物抗逆基因二次数据库得以搭建，该文基于BioPerl 设计了远程自动获取大量抗逆基因序列的程序。此程序灵巧、精悍， Perl 语言强大的文本处理功能使程序能实现不同类型基因序列的远程获取。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹兴芹	新疆师范大学生命科学学院	13	32	4.0	4.0
2	潘伟民	新疆师范大学生命科学学院	27	111	6.0	10.0
3	张晓婧	新疆师范大学生命科学学院	3	4	1.0	2.0