基因组规模代谢网络模型的自动化重构

• 作者: 张梁 柴文平 石贵阳 薛卫
• 来源期刊: 食品与生物技术学报
• 学科: 工学
• 关键词: 基因组规模 代谢网络 自动化重构 直方图
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 957-965
• 页数: 9页
• 分类号: TP391|Q939
• 字数: 6627字
• 语种: 中文

摘要

对基于KEGG在线数据库、Uniprot-MetaCyc数据库,以及同源比对3种构建基因组规模代谢网络模型的方法进行了自动化研究.同时提出了基于反应式字符频度直方图的马氏距离比对算法,并应用于模型整合和模型核心反应的识别.上述自动化方法的研究均在树干毕赤酵母基因组规模代谢网络重构过程中得到运用实施,对于提高模型构建效率意义重大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛卫	南京农业大学信息科学技术学院	24	120	6.0	10.0
2	张梁		8	43	5.0	6.0
3	石贵阳		7	28	4.0	5.0
4	柴文平		1	4	1.0	1.0