橡胶树 EST-SSR标记开发及特性研究

• 作者: 夏志辉 李德军 邓治 郭会娜
• 来源期刊: 农业科学与技术（英文版）
• 关键词: 橡胶树 EST-SSR 分子标记
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 分子生物学?组织培养
• 页码范围: 733-737
• 页数: 5页
• 字数: 1514字
• 语种: 英文

摘要

为进一步开发橡胶树 EST-SSR标记，该研究下载并组装了来自 NCBI和马来西亚橡胶树 EST数据库 EST序列。在3733个组装的橡胶树单一基因中共鉴定到566个潜在的 SSR位点，平均3.96 kb会出现一个 SSR位点。二核苷酸重复为最丰富的 SSR重复类型，接下来是三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复。SSR位点重复单元数目最多的是5，接下来是12、6和7。在该研究中鉴定的51种类型 SSR模体中，二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复分别有6、26、5、3和11种。 GA/CT二核苷酸数目最多，接下来是 TC/AG、AT/TA、CTT/GAA、TTC/AAG和 TCT/AGA。在158个新开发的橡胶树EST-SSR 标记中，99个可在橡胶树品种RRIM600中产生清晰扩增条带。该研究开发的 EST-SSR标记丰富了橡胶树分子标记数量，必将在橡胶树 DNA指纹图谱、遗传多样性、标记辅助选择、遗传图谱等方面得到广泛应用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓治	中国热带农业科学院橡胶研究所	21	69	5.0	7.0
2	夏志辉	中国热带农业科学院橡胶研究所	4	35	3.0	4.0
4	李德军	中国热带农业科学院橡胶研究所	20	42	3.0	6.0
7	郭会娜	中国热带农业科学院橡胶研究所	2	4	2.0	2.0