生菜EST-SSR的分布特征分析

• 作者: 张光望 张明菊 李志良 游杨 王书珍 罗延延
• 来源期刊: 农业科学与技术（英文版）
• 关键词: 生菜 表达序列标签 微卫星 种质资源
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 分子生物学?组织培养
• 页码范围: 2682-2685,2688
• 页数: 5页
• 字数: 1198字
• 语种: 英文

摘要

从NCBI数据库下载了81518条生菜EST序列，处理后得到无冗余序列61757条，共搜索到2040个SSR位点，出现频率为3.3%。三碱基重复是主要的类型，占38.53%，其次是二碱基和六碱基重复，出现次数最低的是四碱基重复。在181种重复基元类型中，(AGA)n和(ATG)n是主导的重复基元类型，分别占12.01%和3.53%。设计合成的30对引物在50份生菜资源进行鉴定，共筛选出4个材料特异性标记。该研究为后续开发生菜多态性 EST-SSR标记，进行种质资源鉴定、分子标记辅助育种、遗传图谱构建奠定了基础。