高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析

• 作者: 孙保娟 孙光闻 庞强强 李德明 李植良 罗少波 金庆敏 陈日远 黎振兴
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茄子 高温胁迫 内参基因 表达稳定性 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 475-486
• 页数: 12页
• 分类号: S641.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0831

摘要

为筛选茄子(Solanum melongenaL.)高温胁迫下稳定表达的内参基因,以不同茄子品系(种)为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术对来自茄子高温胁迫转录组数据库8个候选内参基因(SmEF1a、SmEF2、Sm40sRPS29、Sm60sRPL24、SmTRX、SmCK Ⅰ、SmDAHPS1、SmUCP)和SmActin在不同试验情况下进行表达检测,并结合GeNorm、NormFinder、BestKeeper和ReFinder软件综合评价9个内参基因的表达稳定性.结果表明,在茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4经高温处理不同时间的样品和不同组织样品以及10个耐热性不同的茄子品系(种)中,9个内参基因的表达丰度及稳定性存在差异;茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4高温胁迫处理不同时间样品中表达稳定性最好的是SmEF1a和Sm UCP;其不同组织中表达水平最稳定的是SmEF1a和Sm TR;高温胁迫下不同茄子品系(种)中以SmTRX和SmEF2的表达稳定性最好.综合来看,SmEF1a和SmTRX在所有茄子试验样品中的表达稳定性最好,而SmActin和SmCKⅠ的表达稳定性较差.