天麻基因组微卫星特征分析与分子标记开发

• 作者: 丁家玺 周天华 王家 田伟
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 天麻 微卫星 分子标记开发
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1728-1735
• 页数: 8页
• 分类号: Q346+.5|Q789
• 字数: 4571字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2017.09.1728

摘要

该研究基于第二代测序技术建立了天麻的基因文库,筛选微卫星序列,并对微卫星位点的类型、丰度、长度、偏好性等进行了分析与比较;并为60条重复次数高的微卫星序列设计了引物,运用4个种群80个样本进行了PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测.结果表明:(1)天麻基因组测序得到61 048条基因序列,检测出微卫星位点12 107个,其中二核苷酸重复最多、长度变异大.(2)设计的60对微卫星引物中的20对能扩增出清晰条带且有多态性,每个位点的复等位基因数(Na)在4～14之间,平均为8.40;多态性信息含量(PIC)平均为0.77.该研究开发的天麻微卫星分子标记为开展天麻遗传学研究及种质资源鉴定等工作奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周天华	陕西理工大学生物科学与工程学院	26	86	5.0	7.0
2	王家	陕西理工大学生物科学与工程学院	3	16	2.0	3.0
3	丁家玺	陕西理工大学生物科学与工程学院	5	26	4.0	5.0
4	田伟	陕西理工大学生物科学与工程学院	2	7	2.0	2.0