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摘要:
致病疫霉(Phytophthora infestans)引起的马铃薯晚疫病是影响马铃薯生产的第一大真菌病害.通过致病疫霉基因组开发微卫星标记,旨为致病疫霉群体遗传结构研究提供更系统、有效的标记.利用软件SciRoKo和ClustalX对致病疫霉基因组中微卫星序列长度≥25 bp的适合标记开发的位点及两端序列进行筛选.然后在这些位点的两端序列上设计专一性PCR扩增引物,选择9株致病疫霉菌对引物的专一性和微卫星的多态性进行检测.最后利用40株不同年份和地理来源的致病疫霉菌株对可行性微卫星标记进行等位基因数的确定及其多态性评估,然后选取部分标记对40株致病疫霉群体进行遗传多样性分析.共获得了33个具多态性的微卫星标记,占开发总数的28.7%,其多态信息含量(PIC)值都在0.164~0.614之间,其中PIC≥0.5的标记有7个,0.25 <PIC<0.5的标记有25个,PIC≤0.25的有1个.发现致病疫霉微卫星基因型与其交配型及地理来源有一定相关性,与甲霜灵敏感性不相关.本研究开发出一批具有多态性微卫星标记,为致病疫霉群体遗传学研究机理提供更多多态性高,稳定性强的分子标记.
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基因组
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功能注释
首批海岛棉基因组来源的微卫星标记的分离、评价和定位
海岛棉
微卫星标记
遗传变异
遗传定位
内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 致病疫霉基因组微卫星标记开发
来源期刊 农业生物技术学报 学科
关键词 致病疫霉 基因组 SSR标记
年,卷(期) 2013,(9) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 1110-1118
页数 9页 分类号
字数 4436字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-7968.2013.09.013
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 朱杰华 河北农业大学植物保护学院 90 810 17.0 24.0
2 杨志辉 河北农业大学植物保护学院 61 505 13.0 19.0
3 张宏磊 河北农业大学植物保护学院 4 42 3.0 4.0
4 胡珍珠 河北农业大学植物保护学院 4 15 2.0 3.0
5 张奥川 河北农业大学植物保护学院 1 6 1.0 1.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
致病疫霉
基因组
SSR标记
研究起点
研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
月刊
1674-7968
11-3342/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
2-367
1993
chi
出版文献量(篇)
4211
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8
总被引数(次)
40364
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