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摘要:
芽殖酵母Sch9与哺乳动物S6K1是保守的寿命调控同源蛋白,利用生物信息学手段比较分析了Sch9与S6K1的理化性质、亚细胞定位、信号肽和跨膜区、空间结构、蛋白质相互作用网络、序列同源性及进化关系,以期对Sch9与S6K1的结构功能的深入研究提供线索和基础.结果表明Sch9为酸性稳定性亲水蛋白,而S6K1为酸性不稳定的亲水蛋白,均无信号肽和跨膜区域,两者定位于细胞核的可能性最大.Sch9与S6K1的主要二级结构均为无规卷曲,在进化上相当保守,Sch9属于C2超家族和PKc like超家族,S6K1属于PKc like超家族.Sch9相互作用蛋白主要有Cyr1、Tor1、Tor2、Pkh1/2,而S6K1相互作用蛋白主要有PIK3CA、RHEB、Rps6、RPTOR、mTOR,显示两者的相互作用蛋白保守性也较强.同时,分析显示Sch9与S6K1均具有利于蛋白间相互作用的结构特点,为进一步深入研究Sch9与S6K1的分子功能及调控机制提供了一定的理论参考.
内容分析
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文献信息
篇名 寿命调控同源蛋白Sch9与S6K1的结构与功能分析
来源期刊 生物信息学 学科 生物学
关键词 Sch9 S6K1 生物信息学 结构 功能 相互作用
年,卷(期) 2018,(3) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 148-155
页数 8页 分类号 Q255
字数 4655字 语种 中文
DOI 10.12113/j.issn.1672-5565.201801005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王楠 西南交通大学生命科学与工程学院 13 60 5.0 7.0
2 范磊 西南交通大学生命科学与工程学院 6 76 3.0 6.0
3 黄新河 西南交通大学生命科学与工程学院 18 37 4.0 5.0
4 刘雪飞 西南交通大学生命科学与工程学院 5 10 2.0 3.0
传播情况
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节点文献
Sch9
S6K1
生物信息学
结构
功能
相互作用
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2003
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