DCLK1的空间结构和理化性质分析

• 作者: 刘安 刘畅
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: DCLK1 生物信息学 结构 功能 相互作用蛋白
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 231-238
• 页数: 8页
• 分类号: Q71
• 字数: 4789字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201712002

摘要

DCLK1(Doublecortin-like kinase 1)是胃肠道肿瘤干细胞的分子标志物,也是一个潜在的基因治疗分子靶点,但其致癌机制和预后价值仍未被完全阐明.为了全面认识DCLK1,本文利用生物信息学手段,对DCLK1蛋白的理化性质、组织表达、亚细胞定位、信号肽、跨膜结构域、空间结构、蛋白质相互作用网络及序列同源性进行分析.结果表明人DCLK1基因编码729个氨基酸组成的蛋白,在进化过程中高度保守,属于TGS超家族和PKc like超家族,是碱性不稳定的亲水蛋白,无信号肽和跨膜区域.该蛋白定位于细胞核的可能性最大,主要二级结构为无规卷曲.经GO分析和KEGG通路分析可知,与DCLK1相互作用的蛋白中,NOTCH蛋白、PRDM8和PRUNE2值得深入研究,预示DCLK1存在更为复杂的作用机制.本文结果为进一步研究DCLK1的功能及致癌机制提供了一定的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘畅	山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室	7	5	1.0	1.0
3	刘安	长治医学院附属和济医院骨科	12	10	2.0	2.0