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摘要:
基于火龙果转录组测序序列设计引物,以生物学性状差异明显的11份火龙果种质DNA为材料,采用正交试验设计,对影响火龙果EST-SSR-PCR扩增的2×Taq PCR MasterMix、引物及模板DNA浓度等因素进行了优化,在此基础上对变性聚丙烯酰胺凝胶质量浓度及上样量进行筛选确定.以期建立适合火龙果的EST-SSR-PCR最佳反应体系.结果表明,优化后的火龙果EST-SSR-PCR扩增的最佳反应体系为:10μL混合反应体系含基因组DNA 30 ng、6μL 2×PCR Mix和0.6μL(10-5mol/L)的EST-SSR引物.在聚丙烯酰胺凝胶电泳检测中,10%的变性聚丙烯酰胺凝胶质量浓度、2.5μL上样量扩增效果最佳.该体系的建立可为今后利用EST-SSR标记对火龙果遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供基础.
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文献信息
篇名 火龙果EST-SSR分子标记反应体系的建立与优化
来源期刊 山地农业生物学报 学科 农学
关键词 火龙果 SSR标记 体系优化
年,卷(期) 2018,(3) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 14-20
页数 7页 分类号 S667.9
字数 5594字 语种 中文
DOI 10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2018.03.003
五维指标
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火龙果
SSR标记
体系优化
研究起点
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
山地农业生物学报
双月刊
1008-0457
52-5013/S
大16开
贵阳花溪 贵州大学
66-66
1982
chi
出版文献量(篇)
2486
总下载数(次)
2
总被引数(次)
16056
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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