广东地区口蹄疫病毒VP1和3A基因的序列分析

• 作者: 冀池海 冯松林 刘艺兴 孙彦阔 张桂红 李琪 汪志 石庆伟 谢增胜 邢秀琳 陈耀
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 口蹄疫病毒 VP1基因 3A基因 序列相似性 遗传变异
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 13-18
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3513字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2018.03.003

摘要

[目的]了解广东地区口蹄疫病毒(FMDV)的遗传变异情况,为我国FMDV流行病学的研究及防控提供基础数据.[方法]对2015—2016年间收集的广东地区猪的病料进行FMDV VP1和3A基因的扩增测序和序列分析.[结果]11株O型FMDV均属耿马谱系毒株,7株A型FMDV均属Asia型毒株.11株O型FMDV的VP1基因与流行毒株相比,GD-MM-3株与O/BY/CHA/2010株序列相似性最高,为95.3%;GD-1株、GD-MM-1株和GD-MM-3株与O/MYA/1/98株序列相似性最高,为90.8%.7株A型FMDV的VP1基因与流行毒株相比, A/GDMM/CHA/2013株与GD-3株序列相似性最高,为99.8%;A/HuBWH/CHA/2009株与GD-3株序列相似性最高,为91.4%.11株O型FMDV的3A蛋白不存在氨基酸的缺失,7株A型FMDV的3A蛋白存在较多氨基酸的缺失.[结论]广东部分地区FMDV基因型复杂,预防控制困难.