油菜miR169基因家族的生物信息学分析及靶基因预测

• 作者: 刘红占 王俊生 赵锦慧 阮先乐 陈良兵
• 来源期刊: 浙江农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 油菜 miR169基因家族 靶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 1273-1280
• 页数: 8页
• 分类号: S565.4
• 字数: 4151字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1524.2018.08.01

摘要

为了解油菜miR169基因家族,采用生物信息学的方法对油菜miR169基因家族成员的染色体位置、分子进化、前体序列的保守性、启动子和靶基因进行了分析.结果表明:油菜miR169基因家族成员分布在9条染色体上;系统进化分析表明,这些基因共分成2个组;其前体序列在形成成熟miRNA的位置高度保守;油菜miR169基因家族上游启动子主要元件有13个,数量最多的是胚乳表达元件、厌氧胁迫元件、热响应元件和MBS;油菜miR169基因家族的靶基因一共有16个,大部分属于NF-YA基因家族.该结果为进一步研究油菜miR169基因家族的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阮先乐	周口师范学院生命科学与农学学院	30	63	5.0	7.0
2	赵锦慧	周口师范学院生命科学与农学学院	68	195	7.0	10.0
3	王俊生	周口师范学院生命科学与农学学院	30	48	4.0	5.0
4	刘红占	周口师范学院生命科学与农学学院	14	2	1.0	1.0
5	陈良兵	周口师范学院生命科学与农学学院	7	20	3.0	4.0