拟南芥和酿酒酵母来源的磷脂:甘油二酯酰基转移酶与底物的潜在结合位点分析

• 作者: 万霞 王炼 罗玲 黄庭轩
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 酿酒酵母 磷脂:甘油二酯酰基转移酶 磷脂 分子对接
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 812-819
• 页数: 8页
• 分类号: Q344
• 字数: 4882字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2018.06.010

摘要

为了探究拟南芥和酿酒酵母来源的磷脂:甘油二酯酰基转移酶(PDAT)在油脂积累过程中与底物相互作用的机制,本研究利用蛋白三维结构模拟、分子对接等生物信息学手段对植物、真菌等来源的PDAT进行蛋白进化关系分析以及PDAT与特定底物的分子对接分析.通过模拟PDAT和磷脂分子的空间对接模型,预测出底物和蛋白空间互作的多个关键氨基酸位点.基于多种磷脂分子和拟南芥PDAT(AtPDAT)的分子对接和氨基酸序列比对,AtPDAT氨基酸序列中的W153,E310,D313,V627可能对蛋白质和底物结合发挥重要作用.该结果精确定位AtPDAT及其它来源的PDAT与磷脂底物的结合位点以及催化位点,为下一步AtPDAT蛋白定向改造提供重要的数据支撑.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王炼	中国农业科学院油料作物研究所	3	44	2.0	3.0
2	万霞	中国农业科学院油料作物研究所	21	132	7.0	11.0
14	罗玲	中国农业科学院油料作物研究所	2	0	0.0	0.0
15	黄庭轩	中国农业科学院油料作物研究所	1	0	0.0	0.0