hsa-miR-126的靶基因预测及其生物信息学分析

• 作者: 吴近珠 崔玉宝 张徐 王婷婷 陈妍珂
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 医学
• 关键词: hsa-miR-126 microRNA 靶基因 生物信息学 肿瘤
• 年，卷（期）: 2018,（23）
• 页码范围: 4564-4570
• 页数: 7页
• 分类号: Q-33|Q75|Q78|R318.04
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2018.23.039

摘要

目的:采用生物信息学的方法预测hsa-miR-126 的靶基因及相关功能,为后续研究提供理论基础.方法:采用PubMed 搜索 hsa-miR-126 相关文章,总结目前研究进展,使用miRBase 获得hsa-miR-126 的基本信息,并用NCBI BLAST 分析其序列保守性,以Targetscan 、miRanda 及PicTar 预测结果的两两交集为预测靶基因,并结合miRTarBase 上已证实的靶基因作为基因集合做 GO分析和Pathway分析.结果:搜索PubMed 获得相关文献24 篇,多数研究集中于hsa-miR-126 与肿瘤的关系,hsa-miR-126 在多种物种间具有高度保守性,其5 个预测靶基因和46 个已证实靶基因于白细胞迁移、对糖皮质激素反应、促进内皮细胞增殖、蛋白信号转导等有功能富集(P＜0.01),于多种肿瘤如肾细胞癌、前列腺癌、非小细胞肺癌、胰腺癌有信号通路富集(P＜0.01).结论: hsa-miR-126 可能参与多种肿瘤的发生发展过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王婷婷		25	67	4.0	6.0
2	张徐	江苏大学医学院	27	108	7.0	9.0
3	崔玉宝		12	9	2.0	2.0
4	陈妍珂	江苏大学医学院	1	1	1.0	1.0
5	吴近珠		3	4	1.0	2.0