Mmu-miR-124靶基因预测及通过GSK3B调控神经发育的可能性:基于生物信息学和qPT-PCR分析

• 作者: 孙宇 蒋云凤
• 来源期刊: 组织工程与重建外科杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: Mmu-miR-124 靶基因 生物信息学分析 神经发育
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 227-232
• 页数: 6页
• 分类号: Q813.1+2
• 字数: 3828字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-0364.2019.04.003

摘要

目的 运用生物信息学手段预测Mmu-miR-124靶基因,并进一步揭示Mmu-miR-124在神经发育中的作用.方法 从StarBase数据库中预测出Mmu-miR-124的潜在靶基因.运用GO、Reactome通路、KEGG通路和PPI分析方法,对预测的靶基因的可能机制进行分析.采用逆转录实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证神经发育通路关键基因预测结果的可信度.结果 GO、KEGG与Reactome通路提示,Mmu-miR-124靶基因在轴突导向、长时程压抑和鞘脂类代谢通路中发挥作用;PPI分析表明,GSK3B、NRAS和ITGB1是关键基因;qRT-PCR结果显示,在神经发育过程中Mmu-miR-124表达明显升高,GSK3B表达略下降.结论 Mmu-miR-124通过调控靶基因广泛参与多种生物学过程,Mmu-miR-124可能通过靶向GSK3B调控神经发育.