辣椒CaNRAMP基因家族的鉴定与表达分析

• 作者: 刘峰 王运生 胡灿
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 NRAMP基因家族 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 69-74
• 页数: 6页
• 分类号: S641.301
• 字数: 4434字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.10.016

摘要

为了初步研究辣椒(Capsicum annuum L.)NRAMP家族基因在重金属镉胁迫下的表达情况,通过生物信息学方法从辣椒基因组中鉴定出NRAMP基因,并对这些基因的序列结构、系统进化树、表达谱等进行系统分析.结果表明,辣椒中含有5个具有典型NRAMP结构域的基因,根据其在染色体上的位置,分别将其命名为CaNRAMP1～CaNRAMP5,根据系统进化分析,将辣椒的NRAMP基因分为2类,Ⅰ类包含2个基因(CaNRAMP1、CaNRAMP3),分别含有10、12个内含子,Ⅱ类包含3个基因(CaNRAMP2、CaNRAMP4、CaNRAMP5),均含有3个内含子.基于基因组织表达模式的分析结果表明,CaNRAMP1在不同组织中均未检测到其表达;CaNRAMP5的表达集中在花器官,其余CaNRAMP基因均有不同的表达模式;通过逆转录定量PCR(qRT-PCR)分析发现,辣椒苗期中的叶片经过镉处理后,CaNRAMP3基因呈明显上调的趋势,参与镉胁迫反应的正向调控,其他基因则不参与镉胁迫反应的调控.研究结果为进一步分析辣椒NRAMP基因家族的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘峰	湖南省农业科学院蔬菜研究所	24	98	6.0	9.0
2	王运生		21	661	8.0	21.0
3	胡灿		1	0	0.0	0.0