IgA肾病患者与膜性肾病患者外周血单核细胞mRNA分析

• 作者: 梁爽 凡奎 张燕 谢杨眉
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 医学
• 关键词: IgA肾病 膜性肾病 外周血单核细胞 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 163-168
• 页数: 6页
• 分类号: R692.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/201909003

摘要

为了寻找诊断、鉴别IgA肾病(IgAN)和膜性肾病(MN)的血液特异性标记物,利用公共数据库中的IgAN和MN患者的外周血单核细胞(PBMCs)的转录组表达谱数据集识别特异性生物标记物,为诊断和鉴别提供简便、可靠的依据补充.从公共基因表达数据库(GEO)下载IgAN患者组(n= 15)和MN患者组(n=8)芯片数据集,筛选前250个差异表达基因(DEGs).通过分析筛选关键基因和途径,进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析和蛋白质与蛋白质相互作用关系(PPI)分析等进一步了解DEGs.通过分析共发现75个显著DEGs,其中73个上调基因,2个下调基因.GO富集分析的生物学过程(BP)主要包括蛋白质转运、内溶酶体到溶酶体转运、趋化因子介导的信号通路作用等.显著富集差异表达基因KEGG通路分析包括Endocytosis和Hepatitis B的相关信号通路.PPI筛选出EPS15、STAT4、CCL2、SUN2、SEC24C、SEC31A、GOLGB1、F2R,RAB12和PTK2B等关键基因.成功筛选出核心差异表达基因,为IgAN和MN的诊断和鉴别提供简便、可靠的依据补充,甚至提供治疗的新靶点.