多序列渐进式比对算法研究与比较

• 作者: 王希诚 谷俊峰 赵金城
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物信息学 多序列比对 渐进式比对 BAliBASE
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 73-76
• 页数: 4页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 4512字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2005.02.007

摘要

多序列比对是一种重要的生物信息学工具,在生物的进化分析以及蛋白质的结构预测方面有着重要的应用.以ClustalW为代表的渐进式多序列比对算法在这个领域取得了很大的成功,成为应用最为广泛的多序列比对程序.但其固有的缺陷阻碍了比对精度的进一步提高,近年来出现了许多渐进式比对算法的改进算法,并取得良好的效果.本文选取了其中比较有代表性的几种算法对其基本比对思想予以描述,并且利用多序列比对程序平台BAliBASE和仿真程序ROSE对它们的精度和速度分别进行了比较和评价.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵金城	大连大学生物信息学与分子设计研究所	15	168	9.0	12.0
2	王希诚	大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室	54	538	12.0	21.0
3	谷俊峰	大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室	8	26	3.0	4.0