牙鲆变态早期cDNA文库的构建和parvalbumin基因的克隆

• 作者: 任大明 杨桂梅 鲍宝龙 龚小玲
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牙鲆 变态早期 全长cDNA文库 锚定PCR parvalbumin基因 钙离子结合蛋白
• 年，卷（期）: 2005,（4）
• 页码范围: 467-472
• 页数: 6页
• 分类号: S917
• 字数: 4086字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2005.04.006

摘要

在前期的研究中,克隆到牙鲆变态早期和变态前差异表达的parvalbumin基因片断cDNA.为了克隆parvalbumin基因的全长cDNA, 构建了变态早期 (孵化后23 d仔鱼) 牙鲆头部的全长cDNA文库,并对文库的滴度和插入片段大小进行了评估.同时采用锚定PCR法从cDNA文库筛选出parvalbumin 基因的全长cDNA.结果表明,所构建的牙鲆变态早期头部cDNA文库的滴度为1.2×106 PFU·mL-1,插入片段的平均长度为1 000 bp左右.parvalbumin基因的全长cDNA的长度为603 bp, 编码109个氨基酸,含有两个EF手型钙离子结合域:DQDGSGFIEEEEL (52～64)和DSDGDGKIGVEEF(91～103),以及一个ATP/GTP结合位点模序:ACGLAGKS(33～40),是一种典型的钙离子结合蛋白.通过parvalbumin基因氨基酸序列的同源比较分析表明,牙鲆parvalbumin基因是比较保守的蛋白,与其它鱼类享有61.5%～68.8%序列同源.系统分析表明,牙鲆的parvalbumin基因与狭鳕(Theragra chalcogramma)最为接近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龚小玲	上海水产大学生命科学与技术学院	8	141	6.0	8.0
2	任大明	复旦大学遗传学国家重点实验室	98	819	15.0	24.0
3	鲍宝龙	上海水产大学生命科学与技术学院	16	228	10.0	15.0
7	杨桂梅	上海水产大学生命科学与技术学院	8	104	6.0	8.0