黄瓜叶绿体基因组全序列微卫星分布特征与标记开发

• 作者: 刘颖 李建吾 梁芳芳 胡建斌
• 来源期刊: 细胞生物学杂志
• 关键词: 黄瓜 叶绿体基因组 微卫星 标记
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 69-74
• 页数: 6页
• 语种: 中文

摘要

对黄瓜叶绿体基因组(chloroplast genomic DNA,cpDNA)全序列中微卫星(chloroplast simple sequence repeat,cpSSR)的分布特征进行了全面分析.结果发现,cpSSR主要分布在25～40kb和100～130 kb两个区域,主要以完全重复和间隔重复为主.单碱基重复最多,占总数的79.3%,二碱基重复占10.1%,三碱基和三碱基以上重复仅占10.6%.单碱基重复主要以(A)n和(T)n为主,二者共占总数的78.8%,二碱基重复主要是(AT)n,占总数的9.3%.在重复次数分布上,完全重复的(A)n和(T)n均以最低重复次数为主,而间隔重复的(A)n和(T)n以14次或15次为多.设计了6对引物,对7份黄瓜自交系cpDNA进行扩增.结果发现,6对引物均有扩增产物,每对引物平均能检测到2.2个等位基因.几乎所有引物都能在甜瓜、西瓜、葫芦和栝楼中通用,5对引物在1～4种远缘种中有扩增产物.上述结果表明,从黄瓜cpDNA中发掘cpSSR标记是一条可行的途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李建吾		44	442	12.0	19.0
2	梁芳芳		27	51	4.0	6.0
3	胡建斌		59	510	12.0	20.0
4	刘颖		5	33	2.0	5.0