大鼠全基因组微卫星分布特征研究

• 作者: 严超超 刘晓华 杜联明 涂飞云 黄晓凤
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大鼠 基因组 微卫星序列
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: ?生物技术与食品工程?
• 页码范围: 708-711
• 页数: 4页
• 分类号: S865.1+2
• 字数: 2647字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13836/j.jjau.2015107

摘要

大鼠（ Rattus norvegicus）一直是医学和药学研究中良好的模式生物，其全基因组是继人和小鼠之后第3个被测定的哺乳动物。利用生物信息学软件对大鼠全基因组1～6 bp不同类型重复微卫星进行搜索及统计，表明大鼠全基因组微卫星序列共1483525个，其序列长度占全基因组的1．41％。大鼠全基因组微卫星分布频率以12号染色体最高，其次是10号染色体，最低的是X性染色体。大鼠微卫星数量与染色体DNA序列长度具有相关性（ r＝0．978，P＜0．0001），微卫星分布具有随机性。大鼠全基因组不同重复类型微卫星表现为二碱基（46．9％）＞单碱基（22．6％）＞四碱基（17．7％）＞三碱基（8．4％）＞五碱基（2．4％）＞六碱基（2．0％），单碱基、二碱基、三碱基、四碱基、五碱基、六碱基优势微卫星类型分别是A、AC、AGG、AAAC、AAACA、ACAGAG。本研究为大鼠全基因组微卫星筛选及进一步的研究提供数据支持。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘晓华		43	83	4.0	6.0
2	黄晓凤		67	294	9.0	15.0
3	涂飞云		27	37	3.0	4.0