棉花叶绿体基因组全序列微卫星分布规律研究

• 作者: 刘方 周忠丽 王坤波 王星星 王春英 王玉红 蔡小彦
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 叶绿体微卫星 分布规律
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 570-575
• 页数: 6页
• 分类号: S562.035
• 字数: 3383字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201506009

摘要

利用已公布的陆地棉(Gossypium hirsutum)叶绿体基因组全序列测序结果,应用生物信息学软件对其叶绿体微卫星的分布规律进行了全面分析.结果发现,陆地棉叶绿体基因组上共有72个微卫星,主要分布于大单拷贝区和小单拷贝区,且以单碱基徽卫星为主,占总数的76.4％;二碱基微卫星占总数的20.8％;三碱基微卫星占总数的2.8％.在单碱基微卫星中,又以A/T重复为主,二者共占单碱基微卫星的92.7％.单碱基微卫星的重复次数以10～12次为主,二碱基微卫星的重复次数以5～6次为主.本研究结果为开发棉属植物叶绿体通用引物提供了理论依据.