牙鲆EST资源的SSR信息分析

• 作者: 刘海金 陈松波 龚丽
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牙鲆 EST SSR信息 EST-SSR 重复基元
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 82-86
• 分类号: S963
• 字数: 3146字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9369.2010.10.016

摘要

应用生物信息学方法,对牙鲆EST-SSRs的分布频率及碱基重复特点进行了归纳与分析.结果表明,5 927条牙鲆非冗余EST序列通过在线搜索共检索出471个SSRs,分布于390条EST中,出现频率为7.95%,平均分布距离为7.9 kb.包括了112种重复基元,其中二核苷酸重复基元占主导地位,占总SSR的59.02%.AC是二核苷酸中的优势基元,占二核苷酸重复类型的16.91%.三核苷酸重复基元、四核苷酸重复基元和六核苷酸重复基元分布比较分散,三核苷酸重复基元中GAG数量最多,但仅占三核苷酸重复类型的7.26%.研究结果为牙鲆EST-SSR标记的开发及应用奠定了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘海金		49	832	16.0	27.0
2	陈松波	东北农业大学动物科学技术学院	21	202	7.0	14.0
3	龚丽	东北农业大学动物科学技术学院	5	31	3.0	5.0