砂梨EST-SSR引物开发及其应用

• 作者: 乔玉山 佟兆国 刘金义 崔海荣 王新卫 章镇
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 砂梨 EST-SSR 分子标记
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 1551-1556
• 分类号: Q346+.5
• 字数: 3468字
• 语种: 中文

摘要

利用GenBank和GDR数据库中的995条梨EST序列开发砂梨SSR引物,并根据开发的EST-SSR引物对砂梨'西子绿'×'喜水'F1群体的遗传变异进行分析.结果发现:(1)60个SSR位点分布于54条EST序列中,占整个EST数据库的5.4%,其中二核苷酸重复基元出现频率最高,达51.7%,其次为三核苷酸重复基元占25%.23类重复基序中AT重复基序出现的频率最高,为32.3%.(2)利用开发的25对EST-SSR引物对'西子绿'×'喜水'F1群体的遗传变异分析结果表明,其中9对引物呈现多态性,多态性引物占设计引物的36%;多态性引物扩增产物在F1群体中的等位基因数(No)平均为2,有效等位基因数(Ne)平均为1.932 4,平均杂合度观测值(Ho)和期望杂合度(He)分别为1和0.480 9.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章镇	南京农业大学园艺学院	286	5756	35.0	58.0
3	佟兆国	南京农业大学园艺学院	24	405	10.0	20.0
4	乔玉山	南京农业大学园艺学院	82	1302	22.0	33.0
6	王新卫	南京农业大学园艺学院	5	80	4.0	5.0
7	刘金义	南京农业大学园艺学院	7	77	4.0	7.0
8	崔海荣	南京农业大学园艺学院	2	61	2.0	2.0