基于Petri网T不变量的PHB新陈代谢建模分析

• 作者: 丁德武 何小青 吴璞 陆克中 黄海生
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 工学
• 关键词: 不变量分析 代谢网络 Petri网 系统生物学
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 240-244
• 分类号: Q5|TP339
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.03.014

摘要

从拓扑结构的角度分析生化反应网络是生物信息学研究中的一个热点问题.通过将两种传统的途径分析方法(基元模式和极端途径)与Petri网的T不变量分析进行了比较,结果表明:它们本质上是一致的,但是采用Petri网的T不变量分析更便捷.然后,利用Petri网技术构建了PHB代谢模型.对该模型作了结构分析,将计算得到的23个T不变量进行了分组:I组表示简单的可逆反应,II组表示循环的反应,III组可用于调控ATP/ADP比率,IV组是与PHB生产直接相关的反应,可用于代谢工程以提高PHB的产率.最后讨论了Petri网的T不变量分析在这个领域中的应用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆克中	池州学院数学与计算机科学系	37	123	7.0	9.0
2	黄海生	池州学院数学与计算机科学系	24	192	5.0	13.0
3	吴璞	池州学院数学与计算机科学系	13	33	3.0	5.0
4	丁德武	池州学院数学与计算机科学系	37	85	5.0	7.0
5	何小青	池州学院资源环境系	19	80	3.0	8.0