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湖南农业大学学报(自然科学版)期刊
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鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析
鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析
作者:
何小玲
张巨松
张桦
李建贵
王显生
石书兵
贾钰莹
顾汉艳
麻浩
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
鹰嘴豆
表达序列标签-简单重复序列
频率
特性
摘要:
从NCBI公共数据库下载获得27 904条鹰嘴豆表达序列标签EST,去除其中低质量的和冗余序列后得到全长为6 198 092 bp的11 224 条无冗余EST.利用SSRIT(Simple sequence repeat identification tool)软件共在这些序列中发掘出982个SSR,它们分布于865条EST中,出现频率为8.69%,平均长度为15.58 bp,平均距离为6.31 kb.在鹰嘴豆EST-SSR中,二核苷酸重复是最主要的重复类型(66.90%),其次是三核苷酸重复类型(30.75%),出现最多的重复基元类型是TA/AT(24.95%).
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文献信息
篇名
鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析
来源期刊
湖南农业大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
鹰嘴豆
表达序列标签-简单重复序列
频率
特性
年,卷(期)
2010,(2)
所属期刊栏目
生物科学与技术
研究方向
页码范围
137-141
页数
5页
分类号
S529.024
字数
2272字
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1238.2010.00137
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传播情况
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引文网络
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研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
湖南农业大学学报(自然科学版)
主办单位:
湖南农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1007-1032
CN:
43-1257/S
开本:
大16开
出版地:
长沙市芙蓉区湖南农业大学内
邮发代号:
42-157
创刊时间:
1951
语种:
chi
出版文献量(篇)
3318
总下载数(次)
6
总被引数(次)
37061
相关基金
中国博士后科学基金
英文译名:
China Postdoctoral Science Foundation
官方网址:
http://www.chinapostdoctor.org.cn/index.asp
项目类型:
学科类型:
国家科技支撑计划
英文译名:
官方网址:
http://kjzc.jhgl.org/
项目类型:
重大项目
学科类型:
能源
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
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学科类型:
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湖南农业大学学报(自然科学版)2002
湖南农业大学学报(自然科学版)2001
湖南农业大学学报(自然科学版)2000
湖南农业大学学报(自然科学版)1999
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湖南农业大学学报(自然科学版)2010年第5期
湖南农业大学学报(自然科学版)2010年第4期
湖南农业大学学报(自然科学版)2010年第3期
湖南农业大学学报(自然科学版)2010年第2期
湖南农业大学学报(自然科学版)2010年第1期
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