非正态验证性因子分析在基因整体效应中的应用

• 作者: 刘小琴 张岩波 张春森 李治 罗艳虹 马瑞
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 单核苷酸多态性 非正态 最大似然估计 S-B测度调整估计 验证性因子分析
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 192-195
• 页数: 4页
• 分类号: Q75
• 字数: 2380字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.03.06

摘要

针对SNPs数据不服从正态分布的情况,拟采用S-B测度调整估计方法拟合验证性因子模型,进行SNPs整体效应和关联性分析.用GAW17提供的SNPs数据进行实例分析.本研究随机选取2号染色体上,分布在6个基因之中的13个SNPs作为研究对象,对选取的6个基因做潜变量得分,然后对基因和疾病感染做检验.结果显示:x2/df最大似然估计方法的卡方自由度比为3.59,S-B测度调整估计方法的卡方自由度比x2/df为2.89,最大似然估计方法的RMSEA为0.061,S-B测度调整估计方法的RMSEA为0.052.6个基因对该感染都有影响.由此得出结论,在处理SNPs数据时,使用S-B测度调整估计能得到更好的拟合模型.可以推测这6个基因下的13个SNP位点可能是感染的致病位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张岩波	山西医科大学公共卫生学院卫生学统计教研室	128	812	15.0	21.0
2	罗艳虹	山西医科大学公共卫生学院卫生学统计教研室	42	259	6.0	15.0
3	刘小琴	山西医科大学公共卫生学院卫生学统计教研室	3	10	1.0	3.0
4	马瑞	山西医科大学公共卫生学院卫生学统计教研室	9	27	4.0	4.0
5	李治	山西医科大学公共卫生学院卫生学统计教研室	6	29	2.0	5.0
6	张春森	山西医科大学公共卫生学院卫生学统计教研室	3	8	2.0	2.0