受赤霉素调节的拟南芥F-box基因筛选分析

• 作者: 刘德荣 刘选明 李丽 李新梅 赵小英
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 赤霉素 F-box基因 拟南芥 基因芯片
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 150-157
• 页数: 8页
• 分类号: Q343.1
• 字数: 4515字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2015.03.02

摘要

赤霉素(Gibberellins,GAs)作为一种植物激素,对植物的生长发育具有重要调控作用,但其作用机制有待进一步完善. F-box蛋白是SCF复合体的一个亚基,通过特异性识别底物来调控植物的生长发育. 本研究采用生物信息学方法,通过分析拟南芥基因芯片数据库提供的数据筛选到38个受GA调节的候选F-box基因,并对其中6个基因进行了实时荧光定量PCR验证. PlantCARE分析显示,其中30个基因的启动子区具有GA响应元件、以及IAA、ABA、光、温度干旱胁迫、或生物钟相关的顺式作用元件. 通过分析BioGrid数据库提供的相互作用对象,发现其中18个候选F-box蛋白与GA2ox1, GA3ox1和GA3ox3具有相互作用关系. 基因表达谱分析表明,这些候选F-box基因在拟南芥各个组织器官中都有不同程度的表达,对IAA、ABA、光、温度干旱等胁迫或不同光周期都具有一定的响应. 为深入研究GA调控植物生长发育的分子机制提供了重要线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵小英	湖南大学生物学院	33	159	8.0	11.0
2	刘选明	湖南大学生物学院	88	747	16.0	23.0
3	刘德荣	湖南大学生物学院	2	16	2.0	2.0
4	李丽	湖南大学生物学院	15	104	4.0	10.0
5	李新梅	湖南大学生物学院	12	23	3.0	3.0