碧桃花瓣转录组微卫星特征分析

• 作者: 廖卓毅 张得芳 戴晓港 李淑娴 陈赢男 马秋月
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 碧桃 微卫星 SSR 转录组 高通量测序
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 34-38
• 页数: 5页
• 分类号: Q948|Q78
• 字数: 5310字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.2015.03.007

摘要

为开发碧桃转录组微卫星信息，利用454高通量测序技术，对其花瓣转录组序列进行SSR位点发掘，结果发现含SSR的序列4705条，共得到5668个SSR，平均每3．49 kb出现1个SSR。微卫星序列主要以三碱基重复为主，约占总数的42．66％。笔者共发现516种碱基重复基元，所占比例最高的为（AG／CT）n（18?34％），其次是（ AAG／CTT） n（12?42％）。微卫星多为重复长度小于20 bp 的短序列，长度大于20 bp 的微卫星仅占总数的12?13％。研究还发现碧桃花瓣微卫星的频率和长度呈显著负相关（ P＜0?05），相关系数为－0?246。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	戴晓港	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	17	162	8.0	12.0
2	李淑娴	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	51	641	14.0	23.0
3	张得芳	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	5	187	3.0	5.0
4	陈赢男	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	15	104	7.0	10.0
5	马秋月	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	9	222	6.0	9.0
6	廖卓毅	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	5	69	5.0	5.0