杜仲转录组微卫星特征分析

• 作者: 孙志强 梁小翠 申响保 闫文德
• 来源期刊: 经济林研究
• 学科: 农学
• 关键词: 杜仲 转录组 微卫星
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 47-51
• 页数: 5页
• 分类号: S603.2|S722.3+1
• 语种: 中文
• DOI: 10.14067/j.cnki.1003-8981.2016.04.008

摘要

为给杜仲SSR分子标记的选择提供参考依据，利用MISA软件对杜仲转录组序列进行了微卫星查找，共获得重复单元长度为1～6碱基的29067个微卫星序列。分析这些微卫星序列后发现，在杜仲转录组中，长度为二核苷酸的微卫星重复单元最为丰富，占43.7%；在单碱基重复和二碱基重复这两种类型中，最主要的优势重复单元分别是A/T和AG/CT；在三碱基、四碱基、五碱基重复类型中，(AAN)n、(ANAT)n、(AANAN)n分别为其对应的优势重复单元。杜仲转录组中，微卫星的频率随着微卫星总长度的增加而降低。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	闫文德	中南林业科技大学林学院	123	1921	24.0	36.0
5	孙志强	国家林业局泡桐研究开发中心	19	209	10.0	14.0
6	梁小翠	中南林业科技大学林学院	35	341	11.0	16.0
10	申响保	中南林业科技大学林学院	13	278	7.0	13.0