红花转录物组中筛选的Unigene100791基因克隆、生物信息学分析及功能预测

• 作者: 卢玉彬 强卫东 杜林娜 杨莹 沈彦岐 王清曼 王红雨 郭咏昕 陈笑
• 来源期刊: 食品工业科技
• 学科: 工学
• 关键词: 红花 转录因子 Dof 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（23）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 145-149,155
• 分类号: TS201.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2016.23.019

摘要

目的:克隆红花Unigene100791基因,研究其表达情况;并对该基因的特性进行生物信息学分析,为后续红花代谢调控及提高红花油产量,使其满足食品工业市场需求奠定理论基础.方法:从红花转录物组数据库中筛选得到转录因子Dof相关基因Unigene 100791的中间片段;利用RNAiso plus试剂法提取红花种子总RNA,利用RT-PCR方法反转录得到红花种子cDNA;采用3'Race方法从红花种子中克隆Unigene100791基因的全长序列;通过生物信息学方法对其全长基因进行分析,构建该基因与相关物种的系统进化树,研究其蛋白序列的同源性及其理化性质与结构特征,预测其生物学功能.结果:成功克隆了红花Unigene100791基因,其基因全长1274 bp;开放阅读框981 bp,编码326个氨基酸,理论分子质量约为35026.5 u,理论等电点9.5,带正电残基27个,带负电残基18个,序列含有典型的加尾信号poly(A);红花Unigene 100791基因编码产物与烟草Dof2.4-1亲缘关系较近,属于Dof超家族,此蛋白存在信号肽,不存在跨膜结构.结论:成功克隆了红花Unigene 100791基因,并对其编码的蛋白质进行了生物信息学分析.