琥珀酸对酵母细胞转录组的影响

• 作者: THEKRA Khushafa 刘雪飞 童侨 范磊 黄新河
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 琥珀酸 寿命 压力抗性 转录组 芽殖酵母
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 156-162
• 页数: 7页
• 分类号: Q255
• 字数: 4013字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201802001

摘要

寻找抗衰老活性小分子并研究其作用机制是衰老药物学研究的重点和热点.本文报道了一种新的抗衰老活性小分子琥珀酸,发现琥珀酸可以显著延缓芽殖酵母细胞的衰老并增强细胞的压力抗性.随后,利用DNA Microarray技术及生物信息学手段较系统分析了琥珀酸处理对基因表达谱、基因本体聚类及相关信号通路的影响.结果显示,琥珀酸处理对细胞转录组产生了显著影响,共导致3485个基因的差异表达(P<0.05),其中1335个基因显著上调,2150个基因显著下调.进一步对基因本体聚类及信号通路分析显示,线粒体及核糖体生物合成相关的分子功能、细胞组分、生物学过程和信号通路可能是琥珀酸作用的主要靶点,其他可能的作用靶点还包括蛋白酶体、细胞内吞、过氧化物酶体代谢及细胞自噬等.本研究为进一步阐明琥珀酸介导的寿命及压力调控机制提供了理论参考和研究线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	范磊	西南交通大学生命科学与工程学院	6	76	3.0	6.0
2	黄新河	西南交通大学生命科学与工程学院	18	37	4.0	5.0
3	刘雪飞	西南交通大学生命科学与工程学院	5	10	2.0	3.0
4	THEKRA Khushafa	西南交通大学生命科学与工程学院	1	1	1.0	1.0
5	童侨	西南交通大学生命科学与工程学院	3	2	1.0	1.0