本体:生物医学大数据与精准医学研究的基础

• 作者: ZHENG Jie 何勇群 余红 刘清平 周伟 朱伟民 朱彦 杨啸林 王海河 谢江安 邵晨
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 医学
• 关键词: 可控词表 本体 基因本体 生物医学大数据 精准医学 本体中国
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 7-14
• 页数: 8页
• 分类号: R318
• 字数: 6223字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.201710006

摘要

在最近兴起的生物医学大数据和精准医学研究中,本体正发挥着不可替代的作用.但一大部分人对本体的定义、类型与应用比较混淆.这篇综述对这些问题进行了回答.具体而言,本体使用人和计算机都可以理解的术语及关系集来表述各种实体/概念以及它们之间关系.根据本体的作用,本体可分为三类:具有多关系模型的增强版控制术语集,反映某知识域的本体知识系统,和对元数据在语义上的约束与标准化的元数据本体.基于这些作用,本体被广泛地应用于生物医学数据的标准化、整合、检索与分析,已经知识的挖掘.当代本体学的研究发展迅速,我国刚刚起步,机遇与挑战并存.广泛地开展国内与国际有关本体的合作研究,将促进国内生物医学本体领域研究水平的整体提升,提高生物与临床科研大数据整合与精准医学研究的能力.