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深海太平洋火色杆菌琼胶降解基因分析和琼胶酶Aga0950的表达及酶学性质
深海太平洋火色杆菌琼胶降解基因分析和琼胶酶Aga0950的表达及酶学性质
作者:
产竹华
侯艳平
曾润颖
杨素萍
狄文婕
赵春贵
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
琼胶酶
琼胶寡糖
基因组
太平洋火色杆菌
摘要:
[目的]对深海太平洋火色杆菌(Flammeovirga pacifica WPAGA1)全基因组进行生物信息学分析,筛选获得琼胶酶基因aga0950,采用基因工程手段对该基因的功能和性质进行验证和分析.[方法]采用Illumina HiSeq2500测序技术进行基因组测序分析;采用克隆表达和镍柱纯化方法获得纯aga0950基因表达产物;采用薄层层析(TLC)和离子色谱(IC)法分析酶降解琼胶产物;采用二硝基水杨酸法(DNS)测定琼胶酶活性.[结果]基因组序列分析表明,菌株WPAGA1全基因组拥有13个β-琼胶酶相关基因;氨基酸序列比对显示,同源性为60%-85%,其中aga0950是具有GH16家族典型特征的基因,同源性为67%.纯化的重组酶Aga0950比活力达51770 U/mg,具有高效降解琼胶活性,降解终产物为新琼四糖和新琼六糖;最适温度为50℃,最适pH为4.0-10.0;Co2+、Mn2+和Fe3+促进酶活,Cu2+抑制酶活.[结论]深海菌株WPAGA1具有丰富的琼胶酶基因;属于GH16家族的琼胶酶基因aga0950表达产物具有高效降解胶琼活性和良好的热、酸、碱稳定性.
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β-琼胶酶
克隆表达
琼胶寡糖
内容分析
文献信息
引文网络
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
深海太平洋火色杆菌琼胶降解基因分析和琼胶酶Aga0950的表达及酶学性质
来源期刊
微生物学报
学科
关键词
琼胶酶
琼胶寡糖
基因组
太平洋火色杆菌
年,卷(期)
2018,(3)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
411-422
页数
12页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13343/j.cnki.wsxb.20170191
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
曾润颖
国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室
37
494
12.0
21.0
2
产竹华
华侨大学化工学院生物工程与技术系
2
5
1.0
2.0
6
侯艳平
国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室
1
1
1.0
1.0
7
狄文婕
国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室
2
5
1.0
2.0
8
赵春贵
华侨大学化工学院生物工程与技术系
29
161
7.0
11.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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节点文献
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同被引文献
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2018(1)
参考文献(0)
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
2018(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
琼胶酶
琼胶寡糖
基因组
太平洋火色杆菌
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
微生物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0001-6209
CN:
11-1995/Q
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
邮发代号:
2-504
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
4459
总下载数(次)
15
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