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摘要:
[目的]对深海太平洋火色杆菌(Flammeovirga pacifica WPAGA1)全基因组进行生物信息学分析,筛选获得琼胶酶基因aga0950,采用基因工程手段对该基因的功能和性质进行验证和分析.[方法]采用Illumina HiSeq2500测序技术进行基因组测序分析;采用克隆表达和镍柱纯化方法获得纯aga0950基因表达产物;采用薄层层析(TLC)和离子色谱(IC)法分析酶降解琼胶产物;采用二硝基水杨酸法(DNS)测定琼胶酶活性.[结果]基因组序列分析表明,菌株WPAGA1全基因组拥有13个β-琼胶酶相关基因;氨基酸序列比对显示,同源性为60%-85%,其中aga0950是具有GH16家族典型特征的基因,同源性为67%.纯化的重组酶Aga0950比活力达51770 U/mg,具有高效降解琼胶活性,降解终产物为新琼四糖和新琼六糖;最适温度为50℃,最适pH为4.0-10.0;Co2+、Mn2+和Fe3+促进酶活,Cu2+抑制酶活.[结论]深海菌株WPAGA1具有丰富的琼胶酶基因;属于GH16家族的琼胶酶基因aga0950表达产物具有高效降解胶琼活性和良好的热、酸、碱稳定性.
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文献信息
篇名 深海太平洋火色杆菌琼胶降解基因分析和琼胶酶Aga0950的表达及酶学性质
来源期刊 微生物学报 学科
关键词 琼胶酶 琼胶寡糖 基因组 太平洋火色杆菌
年,卷(期) 2018,(3) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 411-422
页数 12页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13343/j.cnki.wsxb.20170191
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 曾润颖 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室 37 494 12.0 21.0
2 产竹华 华侨大学化工学院生物工程与技术系 2 5 1.0 2.0
6 侯艳平 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室 1 1 1.0 1.0
7 狄文婕 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室 2 5 1.0 2.0
8 赵春贵 华侨大学化工学院生物工程与技术系 29 161 7.0 11.0
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研究主题发展历程
节点文献
琼胶酶
琼胶寡糖
基因组
太平洋火色杆菌
研究起点
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期刊影响力
微生物学报
月刊
0001-6209
11-1995/Q
大16开
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
2-504
1953
chi
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