深海太平洋火色杆菌琼胶降解基因分析和琼胶酶Aga0950的表达及酶学性质

• 作者: 产竹华 侯艳平 曾润颖 杨素萍 狄文婕 赵春贵
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 琼胶酶 琼胶寡糖 基因组 太平洋火色杆菌
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 411-422
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20170191

摘要

[目的]对深海太平洋火色杆菌(Flammeovirga pacifica WPAGA1)全基因组进行生物信息学分析,筛选获得琼胶酶基因aga0950,采用基因工程手段对该基因的功能和性质进行验证和分析.[方法]采用Illumina HiSeq2500测序技术进行基因组测序分析;采用克隆表达和镍柱纯化方法获得纯aga0950基因表达产物;采用薄层层析(TLC)和离子色谱(IC)法分析酶降解琼胶产物;采用二硝基水杨酸法(DNS)测定琼胶酶活性.[结果]基因组序列分析表明,菌株WPAGA1全基因组拥有13个β-琼胶酶相关基因;氨基酸序列比对显示,同源性为60％-85％,其中aga0950是具有GH16家族典型特征的基因,同源性为67％.纯化的重组酶Aga0950比活力达51770 U/mg,具有高效降解琼胶活性,降解终产物为新琼四糖和新琼六糖;最适温度为50℃,最适pH为4.0-10.0;Co2+、Mn2+和Fe3+促进酶活,Cu2+抑制酶活.[结论]深海菌株WPAGA1具有丰富的琼胶酶基因;属于GH16家族的琼胶酶基因aga0950表达产物具有高效降解胶琼活性和良好的热、酸、碱稳定性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾润颖	国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室	37	494	12.0	21.0
2	产竹华	华侨大学化工学院生物工程与技术系	2	5	1.0	2.0
6	侯艳平	国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室	1	1	1.0	1.0
7	狄文婕	国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室	2	5	1.0	2.0
8	赵春贵	华侨大学化工学院生物工程与技术系	29	161	7.0	11.0