Streptomyces bacillaris ATCC15855T中bafilomycin A1合成基因簇的挖掘

• 作者: 刘振 毛相朝 赵守静 高坤鹏
• 来源期刊: 工业微生物
• 关键词: Streptomyces bacillaris ATCC 15855T 全基因组序列 Bafilomycin A1 次级代谢产物 基因簇
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 18-25
• 页数: 8页
• 字数: 5066字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-6678.2019.06.003

摘要

Bafilomycin A1是大环内酯类抗生素,具有广泛的抗癌活性.通过HPLC及HPLC-MS分析Streptomyces bacillaris ATCC 15855T的发酵产物,结果显示S.bacillaris ATCC 15855T发酵能够产生bafilomycin A1.S.bacillaris ATCC 15855T分离自中亚土壤.通过全基因组测序,获得了S.bacillaris ATCC 15855T的完整基因组序列.该基因组由6 957 417 bp的线性染色体组成,GC含量为72.29％.该染色体预测了7 284个开放阅读框架(ORF),18个rRNA操纵子,64个tRNA基因.通过antiSMASH v 4.0.3分析,共预测了39个生物合成基因簇.其中,具有抑制液泡型H(+)ATP酶的bafilomycin A1基因簇与已报道的基因簇相似度为100％.在bafilomycin A1合成基因簇中有19个ORFs.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘振	中国海洋大学食品科学与工程学院	23	118	7.0	10.0
2	毛相朝	中国海洋大学食品科学与工程学院	45	76	5.0	6.0
4	赵守静	中国海洋大学食品科学与工程学院	1	1	1.0	1.0
5	高坤鹏	中国海洋大学食品科学与工程学院	2	1	1.0	1.0