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摘要:
位于基因编码区的DNA突变与基因的功能密切相关.在已知人类基因编码区的突变位点时,如何在基因组上设计引物验证该突变是一个重要的问题.本文利用Python语言开发了引物设计程序MutPrimerDesign.MutPrimerDesign通过解析人类基因组序列数据库以及基因注释信息,转换基因编码区坐标为基因组坐标,并调用Primer3的python程序包接口,可批量自动化完成基因突变位点的引物及探针序列设计.MutPrimerDesign使用简便,可识别多种数据库的基因名称,并能够修改引物常规参数,实现引物的快速调整.
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文献信息
篇名 MutPrimerDesign:用于人类基因编码区域突变位点的引物设计程序
来源期刊 生物信息学 学科 生物学
关键词 引物设计 突变 生物信息学分析
年,卷(期) 2020,(3) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 169-175
页数 7页 分类号 Q344.12
字数 语种 中文
DOI 10.12113/201912004
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引物设计
突变
生物信息学分析
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生物信息学
季刊
1672-5565
23-1513/Q
大16开
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
14-14
2003
chi
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