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MutPrimerDesign:用于人类基因编码区域突变位点的引物设计程序
MutPrimerDesign:用于人类基因编码区域突变位点的引物设计程序
作者:
曹英豪
彭公信
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
引物设计
突变
生物信息学分析
摘要:
位于基因编码区的DNA突变与基因的功能密切相关.在已知人类基因编码区的突变位点时,如何在基因组上设计引物验证该突变是一个重要的问题.本文利用Python语言开发了引物设计程序MutPrimerDesign.MutPrimerDesign通过解析人类基因组序列数据库以及基因注释信息,转换基因编码区坐标为基因组坐标,并调用Primer3的python程序包接口,可批量自动化完成基因突变位点的引物及探针序列设计.MutPrimerDesign使用简便,可识别多种数据库的基因名称,并能够修改引物常规参数,实现引物的快速调整.
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篇名
MutPrimerDesign:用于人类基因编码区域突变位点的引物设计程序
来源期刊
生物信息学
学科
生物学
关键词
引物设计
突变
生物信息学分析
年,卷(期)
2020,(3)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
169-175
页数
7页
分类号
Q344.12
字数
语种
中文
DOI
10.12113/201912004
五维指标
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研究主题发展历程
节点文献
引物设计
突变
生物信息学分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物信息学
主办单位:
哈尔滨工业大学
出版周期:
季刊
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
开本:
大16开
出版地:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
邮发代号:
14-14
创刊时间:
2003
语种:
chi
出版文献量(篇)
937
总下载数(次)
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4610
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