辣椒C3H转录因子家族的生物信息学分析

• 作者: 吉雪花 宋文胜 张中荣 张海英 朱冉冉 李慧姬
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 辣椒 C3H 转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 1784-1791
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.018.001784

摘要

香豆酸-3-羟化酶(p-coumarate 3-hydroxylase,C3H)与木质素生物合成途径密切相关,是细胞色素P450中的一员.本研究利用生物信息学方法,对29条辣椒C3H蛋白序列进行分析,预测其一级结构理化特性、基序、二级结构和三级结构,并用MEGA 5.0在线软件把拟南芥与辣椒的C3H蛋白序列进行比对分析,构建系统进化树.结果 表明:辣椒的C3H蛋白长度介于152～983 aa,分子量和等电点分别介于16 926.8～111 899和4.600 8～9.370 6之间.基序预测发现辣椒C3H家族的10个保守基序中最长的含50个氨基酸;α-螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构,三级结构中都含有螺旋-转角-螺旋结构.进化树分析表明CA00g62090与AT5G26749.1同源性高,CA09g17320与AT3G51120.1同源性高,推测辣椒的CA00-g62090与CA09g17320可能较高程度地参与了木质素合成代谢调控.这为下一步研究C3H基因功能提供科学数据.