基于生物信息学分析的hsa-miR-206靶基因预测

• 作者: 刘晓伟 康治理 武振方 许斌
• 来源期刊: 东南国防医药
• 学科: 医学
• 关键词: hsa-miR-206 生物信息学 靶基因 信号通路
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 118-123
• 页数: 6页
• 分类号: R363|Q522
• 字数: 4648字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-271X.2020.02.002

摘要

目的 应用生物信息学方法 分析hsa-miR-206序列,并进行靶基因功能富集分析、信号通路富集分析,靶基因编码蛋白相互作用分析,为后续研究其功能提供理论基础.方法 通过miRbase、TargetScan、DIANA-microT、MiRDB据库、VENN在线工具、DAVID在线数据库、STRING数据库及Cytoscape软件等在线工具分析hsa-miR-206序列及保守性,预测其靶基因,对预测的靶基因进行功能富集分析(GO分析)、KEGG通路富集分析,并筛选出关键基因.结果 hsa-miR-206序列在各物种间高度保守,GO分析发现hsa-miR-206靶基因功能主要富集在生物合成调节、有机物代谢过程调节、转录调节等生物学过程,KEGG分析表明主要参与Wnt信号通路、T细胞受体信号通路、癌症通路等.蛋白互作显示编码蛋白间存在复杂的相互作用,与hsa-miR-206关系最密切的蛋白有27个,如天冬氨酸-谷氨酸-丙氨酸-天冬氨酸盒解螺旋酶5(DDX5)、人远端上游原件结合蛋白(FUBP1)、天冬氨酸-谷氨酸-丙氨酸-组氨酸盒解螺旋酶15(DHX15)等.结论 hsa-miR-206可能参与肿瘤发生发展中重要的生物学过程及调控机制,为进一步实验验证提供了线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	康治理		1	0	0.0	0.0