甜橙bHLH转录因子家族的鉴定及生物信息学分析

• 作者: 刘海刚 吕陟远 孟富宣 杨玉皎 段元杰 郭淑萍 陆晓英
• 来源期刊: 西南林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甜橙 bHLH 全基因组 转录因子 鉴定 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 73-86
• 页数: 14页
• 分类号: S666.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11929/j.swfu.201906018

摘要

bHLH转录因子家族是第2大转录因子家族,广泛存在于微生物、植物以及动物中.以甜橙为试验材料,通过全基因组数据库搜索鉴定,对bHLH基因进行了理化性质、系统发育、染色体分布、保守基序、蛋白互作生物信息学分析,探讨它们在不同组织的表达情况.结果 表明:共鉴定出126个bHLH基因,其中112个不均匀的分布于9条染色体上,14个分布位置尚未确定;系统发育分析表明甜橙bHLH基因家族可分为16个亚家族,并且给定亚家族中的大多数基因具有相似的基因结构和保守基序.在甜橙中,多个bHLH基因相互作用共同调控其开花、光的形态发生和花色素苷合成等过程;大多数的CsbHLH基因在愈伤组织、叶、花和果实中均有表达.本研究为CsbHLH基因的功能研究奠定了基础,并有助于bHLH基因在其他植物物种中的功能研究.