NGAL基因不同长度片段的克隆及其顺式作用元件定位分析

• 作者: 丘碧波 吴梦峰 李恩民 许丽艳 邱文冰 黄丽娜
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 医学
• 关键词: NGAL基因 顺式作用元件 生物信息学 食管癌细胞
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 53-57
• 页数: 5页
• 分类号: R735.1|Q343.1+2
• 字数: 3191字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2005.02.002

摘要

NGAL(neutrophil gelatinase-associated lipocalin)是lipocalin家族的一个新成员,可能是人类的一种新癌基因,但其在肿瘤中的表达调控机制尚不清楚.应用生物信息学手段对NGAL(X99133,包括外显子和内含子)进行分析发现,此区域内含有许多潜在的顺式作用元件,其中主要为增强子元件.对此设计了以下实验:应用PCR技术从食管癌细胞SHEEC基因组DNA中扩增不同长度的NGAL基因片段,将其连接到PGEMT-eacy载体中进行扩增,并测序.NCBI/BLAST分析确认扩增片段为NGAL基因所有,与实验所设计相吻合.在此基础上并应用KEGG/MOTIF检索分析系统对NGAL基因的上述区段进行了顺式作用元件定位分析,结果共鉴定出5个Score值=100分的顺式作用元件位点.这为NGAL基因增强子的鉴定提供了新线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许丽艳	汕头大学医学院肿瘤病理研究室	76	528	13.0	19.0
2	李恩民	汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室	77	510	12.0	18.0
3	邱文冰	汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室	7	29	4.0	5.0
4	丘碧波	汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室	4	17	3.0	4.0
5	黄丽娜	汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室	2	10	2.0	2.0
6	吴梦峰	汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室	2	10	2.0	2.0