基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
基于实验验证的22种大肠杆菌K12的转录因子结合位点序列,分析了转录因子结合位点每一位置的碱基保守性,提出了预测转录因子结合位点的位置权重矩阵打分函数算法(PWMSA).利用self-consistency和cross-validation两种检验方法对此算法进行检验,self-consistency检验总的预测成功率达到87.59%,cross-validation检验成功率达到85.48%.对基因间序列进行搜索,获得了多个可能的转录因子结合位点.
推荐文章
秦皇岛地区貂源大肠杆菌(E.coli)的分离鉴定及药敏试验分析
水貂
大肠杆菌
分离鉴定
药敏试验
耐药性
E.coli K-12琥珀酸脱氢酶sdhC基因纳米锥的设计及自组装
DNA折纸术
纳米材料
琥珀酸脱氢酶
脱氧核糖核酸
自组装
人干细胞因子在大肠杆菌中的表达研究
重组人SCF
高效稳定表达
SD序列
利用E.coli评价铁碳微电解处理印染废水的生物毒性变化
铁碳微电解
生物毒性
废水
反应
降解
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 大肠杆菌E.coli K-12转录因子结合位点的理论预测
来源期刊 生物信息学 学科 生物学
关键词 转录因子结合位点(TFBS) 位置权重矩阵(PWM) 碱基保守性
年,卷(期) 2007,(3) 所属期刊栏目 技术与方法
研究方向 页码范围 117-120
页数 4页 分类号 Q61
字数 3323字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2007.03.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李前忠 内蒙古大学理工学院物理系 87 366 11.0 15.0
2 林昊 内蒙古大学理工学院物理系 14 79 4.0 8.0
3 杨科利 内蒙古大学理工学院物理系 7 55 3.0 7.0
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (5)
共引文献  (8)
参考文献  (11)
节点文献
引证文献  (1)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
1987(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1988(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1991(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1992(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
1995(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
1996(2)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(1)
1998(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1999(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2000(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2001(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2004(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
2005(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
2007(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
2009(1)
  • 引证文献(1)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
转录因子结合位点(TFBS)
位置权重矩阵(PWM)
碱基保守性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物信息学
季刊
1672-5565
23-1513/Q
大16开
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
14-14
2003
chi
出版文献量(篇)
937
总下载数(次)
6
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导