打分矩阵方法在β-发夹模体识别中的应用

• 作者: 姜雪 胡秀珍
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: β-发夹模体 位置打分矩阵 位置打分函数
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 156-158,167
• 页数: 4页
• 分类号: Q61
• 字数: 3799字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2008.04.004

摘要

用打分矩阵的五种算法,从蛋白质的氨基酸序列出发,以氨基酸为参数,分别对3088个同源性小于40%的蛋白质和2878个同源性小于33%的蛋白质的β-发央模体片断进行了识别.利用self-consistency和10-fold cross-validation两种方法对五种算法进行检验,结果表明,Chverie(1996)算法相对较好,对3088个蛋白质的平均识别精度达到了77.7%和76.1%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡秀珍	内蒙古工业大学理学院	95	77	5.0	6.0
2	姜雪	内蒙古工业大学理学院	19	19	3.0	3.0