Tup1突变对转录抑制局部网络中基因表达的非线性影响

• 作者: 丛建国 任德华 张治洲 王志伟
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 局部基因网络 基因表达变化 非线性 Tup1基因
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 页码范围: 272-276
• 页数: 5页
• 分类号: Q754
• 字数: 4490字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.04.009

摘要

研究基因网络的非线性行为特征是研制基因网络技术的基础.Tup1基因是酵母中作用最为广泛的转录抑制因子之一,利用酵母生物信息学数据库中蛋白相互作用关系,构建一个以Tup1为中心,4个层次741个基因的局部基因网络.统计分析六张Tup1不同突变的基因表达芯片数据,将局部基因网络中的全部基因按照3个网络特征进行统计分析:必需\非必需基因、网络层次和网络节点,并研究这些特征与基因表达之间的关系.初步发现基因表达变化的强度与节点数目成一定的反比关系,必需基因的平均变化程度较非必需基因为低,且由Tup1突变引发的其他基因的表达变化在以Tup1为中心的局部基因网络中近层次网络变化程度较大,远层次网络变化程度较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任德华		6	51	2.0	6.0