H5N2亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析

• 作者: 刘次全 张素霞 王建新
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: 禽流感 血凝素 裂解位点 mRNA二级结构 动态折叠
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 页码范围: 155-158
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65|R373
• 字数: 2395字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.02.019

摘要

以H5N2亚型禽流感病毒毒株血凝素蛋白裂解位点碱性氨基酸为研究对象,对其密码子偏好性和对应mRNA序列的折叠二级结构特点进行研究和分析.旨在探讨裂解位点氨基酸对应mRNA核苷酸片段的二级结构与病毒致病力的关系,希望能对禽流感病毒的研究提供一些基础性信息.将mRNA样本按照序列等步长递增的方法,用RNAstructure 4.1程序预测这些样本的动态延伸折叠二级结构.序列和结构的分析结果:裂解位点的碱性氨基酸对富含腺嘌呤的密码子有强烈偏好;与碱性氨基酸对应的mRNA片段上的核苷酸主要位于折叠二级结构的单链环区,少数位于配对螺旋区.结果表明:裂解位点氨基酸对应的mRNA核苷酸形成发夹端环的大小与其碱性氨基酸的多少具有正相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘次全	云南大学现代理论生物研究中心	36	289	8.0	16.0
10	王建新		7	63	4.0	7.0
11	张素霞		8	3	1.0	1.0