牙鲆基因组(CAG)n微卫星DNA特征分析

• 作者: 刘继红 孙效文 张立冬 王蕾
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 牙鲆 微卫星 磁珠富集
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 807-815
• 页数: 9页
• 分类号: Q94
• 字数: 4669字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2009.06.001

摘要

通过磁珠富集法筛选牙鲆(Paralichthys olivaceus)的微卫星分子标记,采用限制性内切酶Sau 3A Ⅰ对牙鲆完整基因组DNA进行酶切;通过蔗糖溶液梯度离心,收集400～900 bp大小的片段,连接Brown接头,构建牙鲆基因组文库.用生物素标记的微卫星探针(CAG)15,对基因组文库进行杂交,利用磁珠富集含有微卫星的DNA单链序列,并对其进行PCR扩增;将扩增产物连接到pMD18-T载体后转入感受态大肠杆菌DH5α中,得到微卫星序列文库.利用大量质粒检测法进行二次筛选,成功地从牙鲆基因组中分离出含有CAG重复的微卫星序列,测序其中的3000个单菌落,获得2805个(占93.5%)含有微卫星序列的克隆,其中含有微卫星座位3120个,完美型1808个,占57.97%;非完美型226个,占7.25%;混合型1085个,占34.78%.从中选出186个微卫星序列设计120对引物并合成,经过筛选,74对引物可扩增清晰条带,其中68对呈多态性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王蕾	大连水产学院生命科学与技术学院	2	38	2.0	2.0
3	孙效文	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	159	3935	35.0	57.0
6	刘继红	大连水产学院生命科学与技术学院	1	6	1.0	1.0
10	张立冬	大连水产学院生命科学与技术学院	1	6	1.0	1.0