基于CGR的DNA序列的时间序列模型

• 作者: 徐振源 蒋丽丽 高洁
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 数学
• 关键词: 时间序列模型 混沌游戏表示(CGR) DNA序列 长记忆 ARFIMA(p,d,q)模型
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 页码范围: 156-160,164
• 分类号: Q523+.8|O211.61
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.02.015

摘要

利用DNA序列的混沌游戏表示(chaos game representation,CGR),提出了将2维DNA图谱转化成相应的类谱格式的方法. 该方法不仅提供了一个较好的视觉表示,而且可将DNA序列转化成一个时间序列.利用CGR坐标将DNA序列转化成CGR弧度序列,并引入长记忆ARFIMA(p,d,q)模型去拟合此类序列,发现此类序列中有显著的长相关性且拟合度很好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐振源	江南大学理学院	79	731	11.0	25.0
2	高洁	江南大学理学院	24	43	4.0	5.0
6	蒋丽丽	江南大学理学院	3	6	1.0	2.0